Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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