Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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