Protein–RNA interactions for Protein: Q13561

DCTN2, Dynactin subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN2Q13561 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN2Q13561 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms