Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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