Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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