Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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SEMA3FQ13275 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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SEMA3FQ13275 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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SEMA3FQ13275 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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SEMA3FQ13275 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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SEMA3FQ13275 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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SEMA3FQ13275 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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