Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME3Q13232 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NME3Q13232 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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NME3Q13232 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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NME3Q13232 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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NME3Q13232 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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