Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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