Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms