Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFX1Q12986 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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