Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms