Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms