Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms