Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms