Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF11Q05519 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms