Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms