Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms