Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DEFA6Q01524 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms