Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms