Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms