Protein–RNA interactions for Protein: P62937

PPIA, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIAP62937 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPIAP62937 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms