Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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