Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UFM1P61960 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UFM1P61960 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UFM1P61960 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UFM1P61960 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms