Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVPABLB-1P60509 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms