Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms