Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA1P59665 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms