Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP6P59044 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP6P59044 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms