Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBASH3AP57075 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBASH3AP57075 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms