Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGGT1BP53609 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms