Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms