Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POU3F4P49335 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F4P49335 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms