Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms