Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms