Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPOP42166 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPOP42166 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms