Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASRP41180 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASRP41180 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASRP41180 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASRP41180 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASRP41180 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASRP41180 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASRP41180 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASRP41180 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms