Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THBS4P35443 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms