Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms