Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms