Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPS1P31327 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPS1P31327 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPS1P31327 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPS1P31327 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPS1P31327 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPS1P31327 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPS1P31327 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPS1P31327 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPS1P31327 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPS1P31327 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPS1P31327 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms