Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms