Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CD38P28907 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD38P28907 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD38P28907 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD38P28907 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD38P28907 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD38P28907 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD38P28907 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD38P28907 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD38P28907 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD38P28907 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms