Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD1P28340 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLD1P28340 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLD1P28340 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms