Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms