Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VARSP26640 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VARSP26640 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VARSP26640 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VARSP26640 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VARSP26640 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VARSP26640 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms