Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APCP25054 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APCP25054 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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