Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms