Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms