Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EFNA1P20827 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms