Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCNA2P20248 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms