Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB4P16144 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms